MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cupriavidus necator N-1 plasmid BB1p

Total Repeats: 5509

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015727	T	8	8	2318	2325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015727	CG	3	6	2348	2353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015727	GCT	2	6	4009	4014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015727	ACC	2	6	4029	4034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_015727	GCT	2	6	4060	4065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015727	CCG	2	6	4267	4272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_015727	CGGC	2	8	4311	4318	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015727	TTC	2	6	4456	4461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015727	CA	3	6	4496	4501	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015727	GA	3	6	4504	4509	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015727	TGGC	2	8	4519	4526	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015727	GGC	2	6	5769	5774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015727	TGC	2	6	6048	6053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015727	GCC	2	6	6057	6062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_015727	GCGGCT	2	12	6077	6088	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015727	ACGG	2	8	6101	6108	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015727	ATA	2	6	6120	6125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015727	ATT	2	6	6204	6209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015727	CCGC	2	8	6253	6260	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
20	NC_015727	C	7	7	6271	6277	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
21	NC_015727	GCCA	2	8	6302	6309	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015727	GCTC	2	8	6629	6636	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015727	GGC	2	6	6733	6738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015727	CAT	2	6	6740	6745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015727	CCTG	2	8	7040	7047	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015727	GC	3	6	7061	7066	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015727	AAC	2	6	7069	7074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015727	GCGCG	2	10	7079	7088	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
29	NC_015727	CTG	2	6	7522	7527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015727	AGC	2	6	7579	7584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015727	CGCTC	2	10	7600	7609	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
32	NC_015727	TGGT	2	8	8475	8482	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015727	CCG	2	6	8585	8590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_015727	CCGG	2	8	8601	8608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015727	GCC	2	6	9903	9908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_015727	CGCC	2	8	9987	9994	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
37	NC_015727	GTC	2	6	10007	10012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015727	GGA	2	6	10139	10144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015727	AGC	2	6	12144	12149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015727	ACA	2	6	13016	13021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015727	A	6	6	16556	16561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015727	GCG	2	6	16564	16569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015727	TCATGA	2	12	16592	16603	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_015727	GGC	2	6	16616	16621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015727	ATT	2	6	16718	16723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015727	ATGGA	2	10	16796	16805	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015727	GAA	2	6	16852	16857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015727	CCT	2	6	16891	16896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_015727	CGG	2	6	16931	16936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015727	CGG	2	6	16983	16988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015727	GATG	2	8	17046	17053	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015727	GGC	2	6	17080	17085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015727	GT	3	6	17100	17105	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015727	AGTGC	2	10	17254	17263	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_015727	CGG	2	6	17301	17306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015727	TCG	2	6	17328	17333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015727	GT	3	6	17416	17421	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015727	GTG	2	6	17424	17429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015727	GCC	2	6	17444	17449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_015727	GGC	2	6	17457	17462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015727	GGT	3	9	17487	17495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015727	CAG	2	6	17544	17549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015727	GAT	2	6	17591	17596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015727	CGAC	2	8	17668	17675	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_015727	CCG	2	6	17704	17709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_015727	TCT	2	6	17734	17739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015727	CCA	2	6	17746	17751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_015727	CT	3	6	17902	17907	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015727	GA	3	6	17961	17966	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015727	GGT	2	6	18065	18070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015727	CCG	2	6	18153	18158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_015727	GCT	2	6	18182	18187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015727	AG	3	6	18242	18247	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015727	GC	3	6	18300	18305	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_015727	GTG	2	6	18336	18341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015727	TTCA	2	8	20493	20500	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_015727	GC	3	6	20558	20563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_015727	TCC	2	6	21538	21543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_015727	TCCA	2	8	21577	21584	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015727	TCG	2	6	21603	21608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015727	A	7	7	25833	25839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015727	G	6	6	25941	25946	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015727	AAGG	2	8	26880	26887	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015727	GCAG	2	8	27731	27738	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_015727	GGAA	2	8	27753	27760	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015727	GGCA	2	8	28898	28905	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_015727	TGC	2	6	28918	28923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015727	ATGA	2	8	31653	31660	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015727	GAC	2	6	31671	31676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015727	TCC	2	6	31708	31713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_015727	AG	3	6	31721	31726	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015727	TCC	2	6	31764	31769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_015727	GCG	2	6	31770	31775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015727	CTG	2	6	31777	31782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015727	ATG	2	6	31906	31911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015727	GAG	2	6	31930	31935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015727	CTG	2	6	31944	31949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015727	CGG	2	6	31963	31968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015727	GC	3	6	32049	32054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_015727	TCT	2	6	32073	32078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015727	GAG	2	6	32100	32105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015727	AGC	2	6	32124	32129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015727	AAC	2	6	32149	32154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015727	CTG	2	6	32183	32188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015727	GCC	2	6	32214	32219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_015727	GCC	2	6	32227	32232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_015727	ACTG	2	8	32368	32375	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_015727	CTT	2	6	32393	32398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015727	CG	3	6	32460	32465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_015727	TGG	2	6	32551	32556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015727	GAA	2	6	32609	32614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015727	CTCA	2	8	32939	32946	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_015727	GCC	2	6	32963	32968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_015727	GC	3	6	32996	33001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_015727	GAA	2	6	33626	33631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015727	GCAA	2	8	33663	33670	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_015727	TCC	2	6	33798	33803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_015727	CAGG	2	8	33827	33834	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_015727	GAT	2	6	33902	33907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015727	GCC	2	6	34018	34023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_015727	CAC	2	6	34027	34032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_015727	GCCG	2	8	34055	34062	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_015727	GA	3	6	34797	34802	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015727	GCG	2	6	34843	34848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015727	CG	3	6	34847	34852	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_015727	GGGC	2	8	34872	34879	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
127	NC_015727	GTGC	2	8	34885	34892	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_015727	GCA	2	6	34928	34933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_015727	CGT	2	6	35372	35377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015727	TGC	2	6	35382	35387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_015727	CCAC	2	8	35453	35460	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
132	NC_015727	ACC	2	6	35465	35470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_015727	T	7	7	37431	37437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015727	A	6	6	37440	37445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015727	TTC	2	6	38469	38474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015727	GAA	2	6	38477	38482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015727	GCT	2	6	38655	38660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_015727	GCT	2	6	38695	38700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015727	CAT	2	6	38736	38741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_015727	CCT	2	6	39826	39831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_015727	GTC	2	6	39909	39914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_015727	AAG	2	6	39946	39951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015727	GC	3	6	39987	39992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_015727	CCG	2	6	40110	40115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_015727	CAT	2	6	40165	40170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_015727	GGGCG	2	10	41750	41759	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
147	NC_015727	CGC	2	6	41768	41773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_015727	C	6	6	41807	41812	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
149	NC_015727	CTG	2	6	41855	41860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_015727	GA	3	6	42887	42892	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015727	T	6	6	42913	42918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015727	A	6	6	42931	42936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015727	TCAAC	2	10	42987	42996	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
154	NC_015727	GCA	2	6	49490	49495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_015727	GC	3	6	50390	50395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
156	NC_015727	CA	3	6	50409	50414	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
157	NC_015727	GAA	2	6	51427	51432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
158	NC_015727	ATG	2	6	51533	51538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
159	NC_015727	CG	3	6	51544	51549	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
160	NC_015727	G	6	6	51610	51615	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
161	NC_015727	CCCT	2	8	51618	51625	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
162	NC_015727	GGTT	2	8	51755	51762	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
163	NC_015727	GC	4	8	51769	51776	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
164	NC_015727	ATT	2	6	51787	51792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_015727	GAT	2	6	51838	51843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
167	NC_015727	AGC	2	6	51920	51925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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169	NC_015727	GAG	2	6	51981	51986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
170	NC_015727	GTT	2	6	52082	52087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
171	NC_015727	GTGCA	2	10	52102	52111	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
172	NC_015727	GC	3	6	52192	52197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
173	NC_015727	ATT	2	6	52302	52307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_015727	TAA	2	6	52391	52396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_015727	GTC	2	6	52424	52429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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185	NC_015727	CAATT	2	10	58097	58106	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
186	NC_015727	ATC	2	6	58133	58138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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195	NC_015727	TCG	2	6	62784	62789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
196	NC_015727	ACC	2	6	64729	64734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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283	NC_015727	CGC	2	6	75702	75707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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285	NC_015727	GCT	2	6	75829	75834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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430	NC_015727	ATA	2	6	103678	103683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_015727	TGG	2	6	109747	109752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
452	NC_015727	GCC	2	6	109754	109759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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454	NC_015727	GTT	2	6	109933	109938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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462	NC_015727	TGG	2	6	111311	111316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
463	NC_015727	CCG	2	6	111325	111330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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465	NC_015727	TGG	2	6	111642	111647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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